Согласно чл. 99 од Законот за високото образование („Службен весник на Република Македонија“ бр. 35/2008; 103/2008; 26/2009; 83/2009; 99/2009; 115/2010; 17/2011; 51/2011; 123/2012; 15/2013; 24/2013; 41/2014; 116/2014; 130/2014; 10/2015; 20/2015; 98/2015; 145/2015; 154/2015; 30/2016; 120/2016 и 127/2016) во продолжение е објавена Универзитетската листа на слободни изборни предмети за втор циклус на студии:
ФАКУЛТЕТИ
- Градежен факултет
- Економски факултет
- Машински факултет
- Медицински факултет
- Педагошки факултет „Св. Климент Охридски“
- Правен факултет „Јустинијан Први“
- Природно-математички факултет
- Стоматолошки факултет
- Технолошко-металуршки факултет
- Факултет за дизајн и технологии на мебел и ентериер
- Факултет за драмски уметности
- Факултет за електротехника и информациски технологии
- Факултет за земјоделски науки и храна
- Факултет за информатички науки и компјутерско инженерство
- Факултет за ликовни уметности
- Факултет за музичка уметност
- Факултет за физичко образование, спорт и здравје
- Фармацевтски факултет
- Филозофски факултет
- Филолошки факултет „Блаже Конески“
- Факултет за шумарски науки, пејзажна архитектура и екоинженеринг „Ханс Ем
ИНСТИТУТИ
- Економски институт
- Земјоделски институт
- Институт за земјотресно инженерство и инженерска сеизмологија
- Институт за социолошки и политичко-правни истражувања
- Институт за сточарство
ПРИДРУЖНИ ЧЛЕНКИ – ЈАВНИ НАУЧНИ УСТАНОВИ
- Институт за македонска литература
- Институт за македонски јазик „Крсте Мисирков“
- Институт за фолклор „Марко Цепенков“